Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNK4Q9NYG8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms