Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SSU72Q9NP77 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms