Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP1Q9C000 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP1Q9C000 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms