Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBM4Q9BWF3 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms