Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM43Q9BTV4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms