Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RHOXF2Q9BQY4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms