Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EDAQ92838 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EDAQ92838 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
EDAQ92838 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EDAQ92838 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EDAQ92838 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EDAQ92838 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EDAQ92838 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EDAQ92838 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EDAQ92838 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EDAQ92838 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms