Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HERVK_113Q902F9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms