Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC112Q8NEF3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC112Q8NEF3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms