Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZNF248Q8NDW4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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ZNF248Q8NDW4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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