Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYNE4Q8N205 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms