Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms