Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RIF1Q5UIP0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RIF1Q5UIP0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms