Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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FREM1Q5H8C1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FREM1Q5H8C1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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