Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
C4orf17Q53FE4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms