Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC38Q502W7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms