Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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KRTAP21-3Q3LHN1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
KRTAP21-3Q3LHN1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
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