Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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ZNF239Q16600 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
ZNF239Q16600 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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