Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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