Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNA1SQ13698 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1SQ13698 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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