Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SEMA5AQ13591 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SEMA5AQ13591 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms