Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKD2Q13563 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
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