Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GPM6BQ13491 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GPM6BQ13491 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
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