Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAB40BQ12829 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms