Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TROQ12816 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TROQ12816 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TROQ12816 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TROQ12816 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TROQ12816 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TROQ12816 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
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