Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SREBF2Q12772 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SREBF2Q12772 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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