Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SYCNQ0VAF6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms