Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SSRP1Q08945 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms