Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GCNT1Q02742 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GCNT1Q02742 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms