Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK6Q00534 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms