Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P62684 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms