Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSEN1P49768 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms