Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GJA8P48165 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GJA8P48165 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJA8P48165 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJA8P48165 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA8P48165 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA8P48165 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJA8P48165 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms