Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXA13P31271 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXA13P31271 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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HOXA13P31271 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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HOXA13P31271 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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HOXA13P31271 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
HOXA13P31271 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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