Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PLNP26678 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PLNP26678 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms