Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSMA4P25789 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMA4P25789 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms