Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
POLR2AP24928 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
POLR2AP24928 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms