Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LIG1P18858 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LIG1P18858 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIG1P18858 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LIG1P18858 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms