Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATF3P18847 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATF3P18847 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATF3P18847 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms