Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DSPP15924 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DSPP15924 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DSPP15924 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DSPP15924 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms