Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD46P15529 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD46P15529 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD46P15529 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD46P15529 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD46P15529 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD46P15529 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD46P15529 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD46P15529 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD46P15529 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD46P15529 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms