Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GJB1P08034 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GJB1P08034 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GJB1P08034 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms