Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLK3P07288 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLK3P07288 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms