Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ITGB2P05107 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms