Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TRAF3IP2O43734 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TRAF3IP2O43734 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TRAF3IP2O43734 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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