Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FOXO3O43524 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXO3O43524 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms