Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTDSP2O14595 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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