Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGPD3A6NKT7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms