Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
XIRP2A4UGR9 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms