Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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ARL2-SNX15V9GYD0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
ARL2-SNX15V9GYD0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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